Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT1P21579 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT1P21579 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT1P21579 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT1P21579 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYT1P21579 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYT1P21579 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYT1P21579 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYT1P21579 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYT1P21579 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYT1P21579 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT1P21579 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT1P21579 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT1P21579 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT1P21579 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT1P21579 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT1P21579 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT1P21579 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT1P21579 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT1P21579 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT1P21579 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT1P21579 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT1P21579 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT1P21579 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT1P21579 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT1P21579 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT1P21579 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT1P21579 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT1P21579 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT1P21579 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT1P21579 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT1P21579 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT1P21579 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT1P21579 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT1P21579 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT1P21579 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT1P21579 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT1P21579 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT1P21579 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT1P21579 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT1P21579 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT1P21579 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT1P21579 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT1P21579 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYT1P21579 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYT1P21579 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYT1P21579 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT1P21579 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT1P21579 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT1P21579 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT1P21579 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT1P21579 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT1P21579 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms