Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACO1P21399 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACO1P21399 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACO1P21399 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACO1P21399 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACO1P21399 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACO1P21399 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACO1P21399 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACO1P21399 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACO1P21399 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACO1P21399 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACO1P21399 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACO1P21399 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACO1P21399 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACO1P21399 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ACO1P21399 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACO1P21399 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACO1P21399 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACO1P21399 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACO1P21399 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACO1P21399 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms