Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TRHP20396 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRHP20396 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TRHP20396 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TRHP20396 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRHP20396 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRHP20396 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRHP20396 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
TRHP20396 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
TRHP20396 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRHP20396 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRHP20396 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRHP20396 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
TRHP20396 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRHP20396 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRHP20396 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRHP20396 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRHP20396 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRHP20396 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRHP20396 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRHP20396 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRHP20396 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRHP20396 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRHP20396 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRHP20396 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRHP20396 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRHP20396 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRHP20396 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRHP20396 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRHP20396 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRHP20396 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRHP20396 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRHP20396 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRHP20396 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRHP20396 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRHP20396 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRHP20396 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRHP20396 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRHP20396 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
TRHP20396 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRHP20396 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
TRHP20396 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TRHP20396 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TRHP20396 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRHP20396 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRHP20396 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRHP20396 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRHP20396 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TRHP20396 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRHP20396 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRHP20396 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
TRHP20396 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRHP20396 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRHP20396 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRHP20396 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRHP20396 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRHP20396 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRHP20396 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRHP20396 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRHP20396 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRHP20396 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRHP20396 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRHP20396 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRHP20396 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRHP20396 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRHP20396 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRHP20396 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRHP20396 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRHP20396 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRHP20396 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TRHP20396 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRHP20396 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TRHP20396 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TRHP20396 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRHP20396 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRHP20396 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRHP20396 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRHP20396 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRHP20396 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRHP20396 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRHP20396 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRHP20396 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRHP20396 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRHP20396 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TRHP20396 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRHP20396 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRHP20396 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TRHP20396 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRHP20396 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TRHP20396 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRHP20396 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRHP20396 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRHP20396 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TRHP20396 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRHP20396 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRHP20396 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRHP20396 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRHP20396 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
TRHP20396 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRHP20396 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms