Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB5AP20339 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms