Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI1P19237 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms