Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN8P19075 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN8P19075 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN8P19075 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN8P19075 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN8P19075 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN8P19075 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN8P19075 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN8P19075 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN8P19075 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN8P19075 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN8P19075 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN8P19075 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN8P19075 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN8P19075 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN8P19075 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN8P19075 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN8P19075 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN8P19075 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN8P19075 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN8P19075 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN8P19075 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN8P19075 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN8P19075 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN8P19075 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN8P19075 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN8P19075 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN8P19075 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN8P19075 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN8P19075 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN8P19075 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN8P19075 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms