Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB2P17787 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB2P17787 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms