Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
UBTFP17480 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBTFP17480 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBTFP17480 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBTFP17480 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBTFP17480 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBTFP17480 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBTFP17480 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBTFP17480 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBTFP17480 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
UBTFP17480 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
UBTFP17480 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
UBTFP17480 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
UBTFP17480 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
UBTFP17480 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
UBTFP17480 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
UBTFP17480 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
UBTFP17480 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
UBTFP17480 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
UBTFP17480 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
UBTFP17480 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
UBTFP17480 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
UBTFP17480 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
UBTFP17480 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
UBTFP17480 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
UBTFP17480 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
UBTFP17480 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
UBTFP17480 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
UBTFP17480 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
UBTFP17480 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
UBTFP17480 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
UBTFP17480 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
UBTFP17480 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
UBTFP17480 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
UBTFP17480 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
UBTFP17480 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
UBTFP17480 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
UBTFP17480 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
UBTFP17480 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
UBTFP17480 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
UBTFP17480 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
UBTFP17480 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
UBTFP17480 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
UBTFP17480 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
UBTFP17480 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
UBTFP17480 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
UBTFP17480 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
UBTFP17480 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
UBTFP17480 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBTFP17480 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBTFP17480 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBTFP17480 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBTFP17480 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBTFP17480 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBTFP17480 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBTFP17480 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
UBTFP17480 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
UBTFP17480 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
UBTFP17480 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
UBTFP17480 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
UBTFP17480 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
UBTFP17480 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
UBTFP17480 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
UBTFP17480 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
UBTFP17480 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
UBTFP17480 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
UBTFP17480 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
UBTFP17480 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
UBTFP17480 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
UBTFP17480 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
UBTFP17480 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
UBTFP17480 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
UBTFP17480 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
UBTFP17480 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
UBTFP17480 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
UBTFP17480 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
UBTFP17480 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
UBTFP17480 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
UBTFP17480 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
UBTFP17480 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
UBTFP17480 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
UBTFP17480 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
UBTFP17480 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
UBTFP17480 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
UBTFP17480 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
UBTFP17480 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
UBTFP17480 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms