Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYOD1P15172 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYOD1P15172 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms