Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCP1P13796 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LCP1P13796 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCP1P13796 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCP1P13796 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCP1P13796 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCP1P13796 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCP1P13796 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCP1P13796 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCP1P13796 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCP1P13796 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCP1P13796 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCP1P13796 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCP1P13796 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCP1P13796 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCP1P13796 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LCP1P13796 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCP1P13796 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCP1P13796 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCP1P13796 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCP1P13796 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCP1P13796 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCP1P13796 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCP1P13796 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LCP1P13796 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCP1P13796 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCP1P13796 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCP1P13796 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCP1P13796 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCP1P13796 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCP1P13796 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCP1P13796 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCP1P13796 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCP1P13796 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LCP1P13796 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCP1P13796 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCP1P13796 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCP1P13796 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCP1P13796 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCP1P13796 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCP1P13796 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCP1P13796 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCP1P13796 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms