Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-EP13747 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-EP13747 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms