Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODC1P11926 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODC1P11926 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODC1P11926 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ODC1P11926 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODC1P11926 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODC1P11926 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODC1P11926 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODC1P11926 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ODC1P11926 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ODC1P11926 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ODC1P11926 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ODC1P11926 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ODC1P11926 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ODC1P11926 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ODC1P11926 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODC1P11926 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODC1P11926 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODC1P11926 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODC1P11926 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODC1P11926 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms