Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDRP11473 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDRP11473 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDRP11473 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDRP11473 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDRP11473 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDRP11473 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDRP11473 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDRP11473 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDRP11473 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VDRP11473 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VDRP11473 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VDRP11473 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VDRP11473 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VDRP11473 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VDRP11473 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VDRP11473 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VDRP11473 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VDRP11473 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VDRP11473 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VDRP11473 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VDRP11473 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VDRP11473 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VDRP11473 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VDRP11473 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VDRP11473 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VDRP11473 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VDRP11473 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VDRP11473 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VDRP11473 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VDRP11473 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDRP11473 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDRP11473 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VDRP11473 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VDRP11473 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VDRP11473 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VDRP11473 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VDRP11473 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VDRP11473 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VDRP11473 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VDRP11473 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDRP11473 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDRP11473 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms