Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1P11387 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1P11387 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1P11387 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1P11387 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1P11387 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1P11387 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP1P11387 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP1P11387 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP1P11387 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP1P11387 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP1P11387 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP1P11387 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP1P11387 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1P11387 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP1P11387 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP1P11387 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP1P11387 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP1P11387 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP1P11387 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP1P11387 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1P11387 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1P11387 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP1P11387 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP1P11387 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP1P11387 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP1P11387 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP1P11387 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP1P11387 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1P11387 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1P11387 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1P11387 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1P11387 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1P11387 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1P11387 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOP1P11387 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1P11387 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1P11387 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1P11387 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1P11387 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1P11387 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1P11387 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1P11387 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1P11387 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1P11387 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1P11387 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1P11387 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1P11387 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms