Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NR2F1P10589 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR2F1P10589 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR2F1P10589 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR2F1P10589 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NR2F1P10589 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR2F1P10589 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms