Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYNX1P0DP58 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LYNX1P0DP58 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYNX1P0DP58 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYNX1P0DP58 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYNX1P0DP58 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYNX1P0DP58 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYNX1P0DP58 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LYNX1P0DP58 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYNX1P0DP58 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms