Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RGPD1P0DJD0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RGPD1P0DJD0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD1P0DJD0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD1P0DJD0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD1P0DJD0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RGPD1P0DJD0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD1P0DJD0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD1P0DJD0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms