Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00032P0C843 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00032P0C843 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms