Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIL1P09327 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIL1P09327 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIL1P09327 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIL1P09327 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIL1P09327 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIL1P09327 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIL1P09327 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIL1P09327 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIL1P09327 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIL1P09327 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIL1P09327 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIL1P09327 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIL1P09327 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIL1P09327 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIL1P09327 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VIL1P09327 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIL1P09327 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIL1P09327 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIL1P09327 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIL1P09327 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIL1P09327 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIL1P09327 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VIL1P09327 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIL1P09327 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VIL1P09327 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VIL1P09327 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VIL1P09327 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VIL1P09327 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VIL1P09327 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VIL1P09327 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VIL1P09327 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VIL1P09327 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VIL1P09327 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VIL1P09327 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VIL1P09327 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VIL1P09327 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VIL1P09327 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VIL1P09327 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VIL1P09327 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VIL1P09327 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VIL1P09327 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VIL1P09327 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VIL1P09327 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VIL1P09327 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VIL1P09327 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VIL1P09327 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
VIL1P09327 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VIL1P09327 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VIL1P09327 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VIL1P09327 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VIL1P09327 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VIL1P09327 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VIL1P09327 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VIL1P09327 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VIL1P09327 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VIL1P09327 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VIL1P09327 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VIL1P09327 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VIL1P09327 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VIL1P09327 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms