Protein–RNA interactions for Protein: P08670

VIM, Vimentin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIMP08670 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIMP08670 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIMP08670 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIMP08670 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIMP08670 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIMP08670 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIMP08670 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VIMP08670 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VIMP08670 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VIMP08670 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIMP08670 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIMP08670 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIMP08670 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIMP08670 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIMP08670 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIMP08670 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIMP08670 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIMP08670 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VIMP08670 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VIMP08670 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VIMP08670 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VIMP08670 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VIMP08670 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VIMP08670 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VIMP08670 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VIMP08670 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VIMP08670 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VIMP08670 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VIMP08670 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VIMP08670 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VIMP08670 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VIMP08670 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VIMP08670 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VIMP08670 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VIMP08670 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VIMP08670 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VIMP08670 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VIMP08670 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VIMP08670 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VIMP08670 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VIMP08670 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms