Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRM2P04554 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRM2P04554 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRM2P04554 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRM2P04554 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRM2P04554 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRM2P04554 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRM2P04554 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRM2P04554 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRM2P04554 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRM2P04554 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRM2P04554 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRM2P04554 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRM2P04554 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRM2P04554 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRM2P04554 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRM2P04554 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms