Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MYCNP04198 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYCNP04198 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYCNP04198 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYCNP04198 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYCNP04198 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYCNP04198 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYCNP04198 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYCNP04198 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYCNP04198 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYCNP04198 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYCNP04198 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MYCNP04198 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYCNP04198 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYCNP04198 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYCNP04198 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYCNP04198 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYCNP04198 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYCNP04198 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYCNP04198 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYCNP04198 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYCNP04198 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYCNP04198 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYCNP04198 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MYCNP04198 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYCNP04198 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYCNP04198 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYCNP04198 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYCNP04198 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYCNP04198 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYCNP04198 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYCNP04198 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYCNP04198 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYCNP04198 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYCNP04198 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYCNP04198 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYCNP04198 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYCNP04198 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYCNP04198 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYCNP04198 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms