Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTNP04004 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTNP04004 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTNP04004 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTNP04004 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VTNP04004 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTNP04004 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTNP04004 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTNP04004 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTNP04004 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTNP04004 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTNP04004 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTNP04004 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTNP04004 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTNP04004 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTNP04004 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTNP04004 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTNP04004 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTNP04004 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTNP04004 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTNP04004 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTNP04004 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTNP04004 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTNP04004 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTNP04004 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTNP04004 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTNP04004 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTNP04004 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTNP04004 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTNP04004 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTNP04004 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTNP04004 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTNP04004 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTNP04004 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTNP04004 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTNP04004 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTNP04004 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VTNP04004 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTNP04004 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTNP04004 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms