Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	YEL032C-A	YEL032C-A	162 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	DPH1	YIL103W	1278 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YVH1	YIR026C	1095 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	CDC8	YJR057W	651 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	OST6	YML019W	999 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YNL228W	YNL228W	777 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	IZH2	YOL002C	954 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	ENA5	YDR038C	3276 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YDR089W	YDR089W	2610 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	CDC10	YCR002C	969 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	UBC1	YDR177W	648 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	PEX10	YDR265W	1014 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YKE4	YIL023C	1041 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YLR036C	YLR036C	612 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	FLD1	YLR404W	858 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YNL067W-A	YNL067W-A	147 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	RHO5	YNL180C	996 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	MED7	YOL135C	669 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	ECM8	YBR076W	1065 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	RPS9B	YBR189W	588 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	POF1	YCL047C	777 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	CPA2	YJR109C	3357 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	SLA1	YBL007C	3735 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	MDN1	YLR106C	14733 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	STP2	YHR006W	1626 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	SNQ2	YDR011W	4506 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	MAF1	YDR005C	1188 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YEL074W	YEL074W	339 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	TOM20	YGR082W	552 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	UTP11	YKL099C	753 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	RAD33	YML011C	534 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	UNG1	YML021C	1080 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YBR134W	YBR134W	402 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	GPB1	YOR371C	2694 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	UBX5	YDR330W	1503 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	SER3	YER081W	1410 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	RRM3	YHR031C	2172 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	BCH1	YMR237W	2175 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	ACK1	YDL203C	1872 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	FAR1	YJL157C	2493 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YDR442W	YDR442W	393 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	DSD1	YGL196W	1287 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YGR079W	YGR079W	1113 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YHR173C	YHR173C	339 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	DAN1	YJR150C	897 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	PML1	YLR016C	615 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YLR154C-H	YLR154C-H	132 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YLR156C-A	YLR156C-A	132 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YLR157C-C	YLR157C-C	132 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YLR159C-A	YLR159C-A	132 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	URA4	YLR420W	1095 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YMR141C	YMR141C	309 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	DDP1	YOR163W	567 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YOR338W	YOR338W	1092 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	RET3	YPL010W	570 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	GSH2	YOL049W	1476 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	GCN1	YGL195W	8019 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	GPI1	YGR216C	1830 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	GYP6	YJL044C	1377 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	TYR1	YBR166C	1359 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	UBP5	YER144C	2418 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	SMC3	YJL074C	3693 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	ALE1	YOR175C	1860 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	PRS5	YOL061W	1491 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YAL004W	YAL004W	648 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	RPC19	YNL113W	429 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	ASI2	YNL159C	870 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	WRS1	YOL097C	1299 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	MSD1	YPL104W	1977 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	CDS1	YBR029C	1374 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	KTR6	YPL053C	1341 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	MIF2	YKL089W	1650 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	TFC1	YBR123C	1950 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YDR149C	YDR149C	708 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	COX18	YGR062C	951 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	CPR8	YNR028W	927 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	TMA16	YOR252W	537 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	DER1	YBR201W	636 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YEL025C	YEL025C	3567 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	TIF4631	YGR162W	2859 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	LCB4	YOR171C	1875 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	LTV1	YKL143W	1392 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	SIR2	YDL042C	1689 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	TEC1	YBR083W	1461 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	RRN6	YBL014C	2685 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	MSW1	YDR268W	1140 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YDR271C	YDR271C	372 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	YDR445C	YDR445C	408 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	PUG1	YER185W	912 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	ERJ5	YFR041C	888 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	BET1	YIL004C	429 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	TMA19	YKL056C	504 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	RIM11	YMR139W	1113 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	RPL13B	YMR142C	600 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	IMP1	YMR150C	573 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	MED4	YOR174W	855 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	ELC1	YPL046C	300 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	P02381	IMH1	YLR309C	2736 nt		2.72	□□□□□ -1.97

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