Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFP01375 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFP01375 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFP01375 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFP01375 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFP01375 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFP01375 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFP01375 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFP01375 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFP01375 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFP01375 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFP01375 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFP01375 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFP01375 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFP01375 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFP01375 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFP01375 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFP01375 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFP01375 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFP01375 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFP01375 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFP01375 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFP01375 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFP01375 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFP01375 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFP01375 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFP01375 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFP01375 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFP01375 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFP01375 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFP01375 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFP01375 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFP01375 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFP01375 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFP01375 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFP01375 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFP01375 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFP01375 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFP01375 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFP01375 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFP01375 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFP01375 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFP01375 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFP01375 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFP01375 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFP01375 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFP01375 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFP01375 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFP01375 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFP01375 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFP01375 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFP01375 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFP01375 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFP01375 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFP01375 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFP01375 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFP01375 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms