Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASS1P00966 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASS1P00966 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASS1P00966 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASS1P00966 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASS1P00966 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASS1P00966 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASS1P00966 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASS1P00966 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASS1P00966 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASS1P00966 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASS1P00966 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASS1P00966 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASS1P00966 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ASS1P00966 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASS1P00966 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASS1P00966 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASS1P00966 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASS1P00966 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASS1P00966 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASS1P00966 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASS1P00966 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASS1P00966 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASS1P00966 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASS1P00966 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASS1P00966 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASS1P00966 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASS1P00966 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASS1P00966 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASS1P00966 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ASS1P00966 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms