Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDHAP00338 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHAP00338 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHAP00338 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHAP00338 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHAP00338 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHAP00338 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHAP00338 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHAP00338 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHAP00338 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHAP00338 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHAP00338 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHAP00338 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHAP00338 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHAP00338 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHAP00338 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHAP00338 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHAP00338 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHAP00338 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHAP00338 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHAP00338 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHAP00338 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHAP00338 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHAP00338 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHAP00338 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHAP00338 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHAP00338 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHAP00338 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHAP00338 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHAP00338 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LDHAP00338 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LDHAP00338 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LDHAP00338 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHAP00338 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHAP00338 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHAP00338 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHAP00338 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHAP00338 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHAP00338 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHAP00338 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHAP00338 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHAP00338 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHAP00338 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHAP00338 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHAP00338 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHAP00338 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHAP00338 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHAP00338 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHAP00338 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDHAP00338 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDHAP00338 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDHAP00338 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDHAP00338 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDHAP00338 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDHAP00338 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDHAP00338 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDHAP00338 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDHAP00338 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDHAP00338 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDHAP00338 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDHAP00338 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LDHAP00338 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDHAP00338 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDHAP00338 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDHAP00338 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDHAP00338 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDHAP00338 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDHAP00338 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDHAP00338 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDHAP00338 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LDHAP00338 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms