Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MBD3O95983 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD3O95983 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD3O95983 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD3O95983 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD3O95983 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD3O95983 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD3O95983 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD3O95983 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD3O95983 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD3O95983 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD3O95983 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD3O95983 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD3O95983 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD3O95983 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD3O95983 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD3O95983 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD3O95983 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD3O95983 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MBD3O95983 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MBD3O95983 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MBD3O95983 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MBD3O95983 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MBD3O95983 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MBD3O95983 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD3O95983 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MBD3O95983 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MBD3O95983 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MBD3O95983 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MBD3O95983 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD3O95983 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD3O95983 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD3O95983 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD3O95983 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD3O95983 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD3O95983 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD3O95983 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD3O95983 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD3O95983 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD3O95983 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD3O95983 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD3O95983 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms