Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD1O95696 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD1O95696 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD1O95696 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD1O95696 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD1O95696 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRD1O95696 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD1O95696 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD1O95696 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD1O95696 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD1O95696 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD1O95696 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD1O95696 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD1O95696 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD1O95696 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD1O95696 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRD1O95696 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD1O95696 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD1O95696 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD1O95696 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD1O95696 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD1O95696 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD1O95696 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD1O95696 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD1O95696 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRD1O95696 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRD1O95696 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRD1O95696 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD1O95696 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD1O95696 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD1O95696 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD1O95696 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD1O95696 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD1O95696 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD1O95696 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD1O95696 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD1O95696 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD1O95696 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD1O95696 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD1O95696 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD1O95696 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD1O95696 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD1O95696 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD1O95696 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD1O95696 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD1O95696 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD1O95696 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD1O95696 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD1O95696 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD1O95696 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD1O95696 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD1O95696 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD1O95696 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD1O95696 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD1O95696 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms