Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24AO95486 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24AO95486 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms