Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSPG5O95196 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSPG5O95196 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSPG5O95196 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 477.6 ms