Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG12O94817 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG12O94817 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG12O94817 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG12O94817 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG12O94817 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG12O94817 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG12O94817 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG12O94817 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG12O94817 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG12O94817 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG12O94817 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG12O94817 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG12O94817 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG12O94817 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG12O94817 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG12O94817 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG12O94817 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG12O94817 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms