Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM1O75626 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms