Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPM3O75607 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPM3O75607 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPM3O75607 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPM3O75607 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPM3O75607 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NPM3O75607 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NPM3O75607 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NPM3O75607 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPM3O75607 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NPM3O75607 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPM3O75607 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPM3O75607 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPM3O75607 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPM3O75607 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPM3O75607 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPM3O75607 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPM3O75607 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NPM3O75607 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NPM3O75607 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPM3O75607 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPM3O75607 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPM3O75607 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPM3O75607 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPM3O75607 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NPM3O75607 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPM3O75607 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPM3O75607 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPM3O75607 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPM3O75607 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPM3O75607 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPM3O75607 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPM3O75607 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPM3O75607 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPM3O75607 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPM3O75607 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPM3O75607 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPM3O75607 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPM3O75607 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms