Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP3O75154 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms