Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PPFIA3O75145 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPFIA3O75145 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIA3O75145 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms