Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COBLO75128 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLO75128 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLO75128 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLO75128 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLO75128 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLO75128 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COBLO75128 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COBLO75128 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COBLO75128 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COBLO75128 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLO75128 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLO75128 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLO75128 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLO75128 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLO75128 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLO75128 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLO75128 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COBLO75128 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLO75128 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLO75128 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLO75128 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLO75128 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLO75128 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COBLO75128 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COBLO75128 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLO75128 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLO75128 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLO75128 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLO75128 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLO75128 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLO75128 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLO75128 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLO75128 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COBLO75128 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLO75128 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLO75128 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLO75128 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLO75128 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLO75128 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLO75128 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLO75128 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLO75128 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLO75128 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLO75128 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COBLO75128 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLO75128 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLO75128 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLO75128 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLO75128 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLO75128 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLO75128 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLO75128 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLO75128 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLO75128 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLO75128 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COBLO75128 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms