Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9AO75110 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms