Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LY75O60449 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LY75O60449 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LY75O60449 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LY75O60449 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LY75O60449 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LY75O60449 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LY75O60449 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LY75O60449 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LY75O60449 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LY75O60449 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LY75O60449 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LY75O60449 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LY75O60449 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LY75O60449 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LY75O60449 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LY75O60449 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LY75O60449 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LY75O60449 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LY75O60449 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LY75O60449 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LY75O60449 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LY75O60449 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LY75O60449 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LY75O60449 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LY75O60449 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LY75O60449 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LY75O60449 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LY75O60449 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LY75O60449 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LY75O60449 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LY75O60449 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LY75O60449 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LY75O60449 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY75O60449 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY75O60449 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY75O60449 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LY75O60449 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY75O60449 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY75O60449 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY75O60449 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY75O60449 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LY75O60449 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LY75O60449 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LY75O60449 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LY75O60449 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LY75O60449 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LY75O60449 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LY75O60449 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LY75O60449 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LY75O60449 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LY75O60449 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LY75O60449 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LY75O60449 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LY75O60449 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY75O60449 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY75O60449 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY75O60449 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY75O60449 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY75O60449 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY75O60449 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY75O60449 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY75O60449 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY75O60449 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY75O60449 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY75O60449 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY75O60449 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY75O60449 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY75O60449 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY75O60449 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY75O60449 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LY75O60449 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY75O60449 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY75O60449 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms