Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYTH3O43739 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYTH3O43739 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms