Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDELR3O43731 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDELR3O43731 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms