Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM44O43615 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms