Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNQ3O43525 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms