Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP290O15078 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP290O15078 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP290O15078 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP290O15078 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP290O15078 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP290O15078 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP290O15078 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP290O15078 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP290O15078 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP290O15078 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP290O15078 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP290O15078 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP290O15078 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP290O15078 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP290O15078 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP290O15078 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP290O15078 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP290O15078 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP290O15078 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP290O15078 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP290O15078 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP290O15078 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP290O15078 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP290O15078 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP290O15078 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP290O15078 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP290O15078 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP290O15078 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP290O15078 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP290O15078 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP290O15078 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP290O15078 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP290O15078 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP290O15078 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP290O15078 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP290O15078 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP290O15078 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP290O15078 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP290O15078 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP290O15078 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP290O15078 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CEP290O15078 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP290O15078 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP290O15078 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP290O15078 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP290O15078 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP290O15078 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP290O15078 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP290O15078 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP290O15078 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP290O15078 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP290O15078 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP290O15078 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP290O15078 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP290O15078 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP290O15078 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
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