Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2SURPO15042 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
U2SURPO15042 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms