Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3EO15041 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA3EO15041 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA3EO15041 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA3EO15041 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA3EO15041 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3EO15041 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3EO15041 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3EO15041 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3EO15041 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms