Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APAF1O14727 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APAF1O14727 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
APAF1O14727 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APAF1O14727 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APAF1O14727 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APAF1O14727 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APAF1O14727 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APAF1O14727 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APAF1O14727 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APAF1O14727 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APAF1O14727 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APAF1O14727 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APAF1O14727 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APAF1O14727 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APAF1O14727 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APAF1O14727 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APAF1O14727 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APAF1O14727 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APAF1O14727 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APAF1O14727 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APAF1O14727 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APAF1O14727 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APAF1O14727 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APAF1O14727 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
APAF1O14727 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APAF1O14727 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APAF1O14727 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APAF1O14727 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APAF1O14727 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APAF1O14727 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APAF1O14727 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APAF1O14727 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APAF1O14727 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APAF1O14727 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APAF1O14727 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APAF1O14727 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APAF1O14727 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
APAF1O14727 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APAF1O14727 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APAF1O14727 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
APAF1O14727 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
APAF1O14727 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APAF1O14727 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APAF1O14727 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APAF1O14727 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APAF1O14727 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
APAF1O14727 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APAF1O14727 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms