Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CUX2O14529 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CUX2O14529 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CUX2O14529 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CUX2O14529 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CUX2O14529 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CUX2O14529 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CUX2O14529 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CUX2O14529 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CUX2O14529 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CUX2O14529 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CUX2O14529 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CUX2O14529 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CUX2O14529 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CUX2O14529 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CUX2O14529 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CUX2O14529 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CUX2O14529 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CUX2O14529 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CUX2O14529 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CUX2O14529 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CUX2O14529 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CUX2O14529 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
CUX2O14529 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CUX2O14529 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CUX2O14529 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CUX2O14529 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CUX2O14529 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CUX2O14529 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CUX2O14529 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CUX2O14529 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CUX2O14529 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CUX2O14529 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CUX2O14529 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CUX2O14529 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CUX2O14529 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CUX2O14529 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CUX2O14529 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CUX2O14529 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CUX2O14529 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CUX2O14529 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CUX2O14529 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CUX2O14529 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CUX2O14529 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CUX2O14529 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CUX2O14529 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CUX2O14529 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CUX2O14529 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CUX2O14529 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CUX2O14529 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CUX2O14529 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CUX2O14529 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CUX2O14529 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CUX2O14529 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CUX2O14529 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CUX2O14529 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CUX2O14529 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CUX2O14529 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CUX2O14529 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CUX2O14529 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CUX2O14529 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CUX2O14529 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CUX2O14529 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CUX2O14529 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CUX2O14529 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CUX2O14529 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CUX2O14529 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CUX2O14529 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CUX2O14529 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CUX2O14529 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CUX2O14529 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CUX2O14529 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CUX2O14529 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CUX2O14529 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CUX2O14529 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CUX2O14529 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CUX2O14529 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CUX2O14529 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CUX2O14529 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CUX2O14529 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CUX2O14529 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CUX2O14529 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CUX2O14529 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CUX2O14529 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CUX2O14529 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CUX2O14529 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CUX2O14529 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CUX2O14529 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CUX2O14529 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CUX2O14529 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CUX2O14529 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CUX2O14529 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CUX2O14529 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CUX2O14529 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CUX2O14529 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CUX2O14529 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CUX2O14529 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CUX2O14529 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CUX2O14529 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CUX2O14529 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms