Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRTO14522 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRTO14522 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
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