Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIBO00712 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIBO00712 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIBO00712 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIBO00712 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIBO00712 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIBO00712 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIBO00712 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIBO00712 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIBO00712 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIBO00712 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIBO00712 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIBO00712 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIBO00712 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIBO00712 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIBO00712 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIBO00712 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIBO00712 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIBO00712 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIBO00712 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIBO00712 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFIBO00712 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFIBO00712 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFIBO00712 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFIBO00712 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIBO00712 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIBO00712 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIBO00712 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIBO00712 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIBO00712 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIBO00712 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIBO00712 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIBO00712 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIBO00712 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIBO00712 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIBO00712 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIBO00712 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIBO00712 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIBO00712 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIBO00712 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIBO00712 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIBO00712 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NFIBO00712 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIBO00712 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIBO00712 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIBO00712 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIBO00712 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIBO00712 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIBO00712 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIBO00712 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFIBO00712 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIBO00712 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIBO00712 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIBO00712 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIBO00712 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIBO00712 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIBO00712 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIBO00712 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIBO00712 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIBO00712 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIBO00712 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFIBO00712 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms